西野研実習2日目/NishinoLabExperiment Course Day2
初日のガイダンスとソフトウエアを使った組換えベクターの解析を踏まえて、 2日目は実際に実験を行う実験班とタンパク質の構造をソフトウエアを使って解析する班に分かれました。 実習室では、M2の関くんの取りまとめのもとで本日の実験内容の確認を行いました。...
2023年度バイオインフォマティクス川柳第五週目優秀川柳賞/2023Bioinformatics Haiku prize week5
先週はゲノム解析を学びました。 最近の塩基配列解析技術の進歩により、さまざまな生物種のゲノムの塩基配列が明らかになっています。 また、特定の生物種において個別の塩基配列の違いを解析するリシークエンスも盛んに行われています。...
西野研実習1日目/NishinoLabExperiment Course Day1
秋晴れの中、学部３年生対象の西野研実習が始まりました。 今年度は３年生が101名で、17つの班に分かれて実験と演習を行います。 実習開始前には取りまとめ役のM2の関田くんより概要説明がありました。 特に卒研生は初めての実習班の指導となるため、うまくいかなかった際の対応法など...
2023年度バイオインフォマティクス川柳第四週目優秀川柳賞/2023Bioinformatics Haiku prize week4
先週は、構造バイオインフォマティクスを学びました。 DNAやRNA, タンパク質などの整体分子は、特定の折れたたまり構造によって機能します。 一次配列上で、遠く離れた位置にある残基も折れたたまれた状態で近接し、酵素の場合は活性中心を形成します。...
森上さん、お誕生日おめでとう！/Happy Birthday, Mai!
今日は森上さんの誕生日祝いをしました。 同期の山縣さんよりShiroのヘアオイルのプレゼントです。 学籍番号も近く、普段のゼミでも続きで発表行うことが多いので、お互いに気心が知れています。 私はチョコバナナケーキを焼いてきました。...
ゼミ合宿２０２３/Lab Trip 2023
ゼミ合宿を一泊二日で行って来ました。 秋晴れの中、今年は房総半島巡りです。 まずは途中のレストランで腹ごしらえです。 続いて館山まで移動して、海釣りです。 釣竿やえさ、道具を借りて防波堤で釣り糸を垂れました。 最初はどうなるか心配しましたが、運も味方をしたようで、思ったより...
2023年度バイオインフォマティクス川柳第三週目優秀川柳賞/2023Bioinformatics Haiku prize week3
先週は配列解析の２回目、マルチプルアラインメントを学びました。 一対一のアラインメントからは一致、不一致、ギャップの場所が分かりますが、 一致している部分の保存の程度や意義は分かりません。 また、二つの配列がどちらがどのように変化/進化したのかも推測の域を出ません。...
2023年度バイオインフォマティクス川柳第二週目優秀川柳賞/2023Bioinformatics Haiku prize week2
先週は配列解析の一回目の講義です。 配列解析はバイオインフォマティクスの基本です。 DNAやRNAなどの遺伝情報やタンパク質のアミノ酸配列情報は生命の理解に欠かせません。 配列がどのような意味を持つのか、機能が何どのようなものであるかを知るためには既存の配列との比較が重要で...
お帰りなさい(旧)バイオカップ/Welcome home ex-Biocup
今日は学科のスポーツイベント、バイオカップを行いました。 競技は例年と同じくソフトバレーボール大会です。 今年は昨年とは異なり12の研究室のみが参加する対抗戦です。 4つのリーグに分かれた予選、予選の２位同士による1部、2部への振り分け、...
2023年度バイオインフォマティクス川柳第一週目優秀川柳賞/2023Bioinformatics Haiku prize week1
先週より後期の講義が始まりました。 今年度はカリキュラム改訂により、一年生の必修科目になりました。 ２年生は引き続き選択必修科目のため、今年度は２学年合同科目です。 初回の履修ははなんと220名（！）、コロナによる教室の収容定員が緩和されましたが、...