染色体構造生物学 西野研究室
Chromosome Structural Biology Nishino Laboratory
2024年度バイオインフォマティクス川柳
８週目
７週目
Bisulfite 非メチル化Cを Uにする
BS処理で マッピングしよう DNA
DNA BS処理で シーケンス
DNA いろんな科目 つながった
KEGG パスウェイ使い 機能発見
KEGG 矢印多すぎて 目がまわる
TとU 混在するの 気味悪い
アミノ基が とれてウラシル これなんだ
アンプリコン 系統組成 解明す
アンプリコン 足跡辿って 見る繋がり
えっみつけた 道しるべたどる 感動だ
エピゲノム かわいい名前で 遺伝子いじる
エピゲノム なぜ見つからない エチル化？
エピゲノム メチル化合図 抑制だ
エピゲノム 医療の未来を 託したぞ
エピゲノム 隠れた秘密 明らかに
エピゲノム 解析方法 3種類
エピゲノム 環境次第で 俺も変わる
エピゲノム 環境変われば 道変わる
エピゲノム 記憶の足跡 継承す
エピゲノム 後天的に 付加される
エピゲノム 使う遺伝子 切り替える
エピゲノム 制御するのは 発現だ
エピゲノム 静かに紡ぐ 運命図
エピゲノム 双子の違う 手の形
エピゲノム 発現制御 クロマチン
エピゲノム 発現制御 しておくれ
エピゲノム 発現制御に 関与する
エピゲノム 発現制御の 作用機構
グラフから 見つけてみよう パスウェイを
クロマチン 制御している エピゲノム
ケグにより マップでわかるぞ わかりやすい
シトシンよ 教えておくれ メチル化か
ショットガン ゲノムの全容 切り拓く
ショットガン 遺伝子解析 乱れうち
ショットガン 遺伝子機能を 丸裸
ショットガン 塩基配列 断片化
ショットガン 君のゲノムを 乱れ撃ち
ショットガン 銃じゃなくて 解析法
ショットガン 未知のゲノムを ロックオン
そっくりな 双子の違いは エピゲノム
たくさんの 細菌分類 Binning
タンパク質 相互作用する シグナル伝達
ついにきた 期末に向けて 大復習
テストまで 忘れないよう 復習だ
パスウェイ いろんな経路 たどれるね
パスウェイ 酵素によって 道決まる
パスウェイが 遺伝子予測の 手助けに
パスウェイが 命の道を 導いて
パスウェイで microな世界の 地図見っけ！
パスウェイで オーソロガスを 解明だ
パスウェイで 遺伝子機能 予測する
パスウェイで 共通遺伝子 見つけたり
パスウェイで 経路を発見 ウェイウェイウェイ
パスウェイで 見つけてみよう 相互作用
パスウェイで 細胞内相互関係 可視化する
パスウェイで 生命(いのち)の謎を 解明だ
パスウェイで 生命システム 理解しよう
パスウェイで 道をたどって 知る酵素
パスウェイで 反応経路を 推量だ
パスウェイで 描いていこう よき未来
パスウェイで 迷わず全ての 情報網
パスウェイの 先に見えるは 未来の鍵
パスウェイの 相互作用で 創り出す
パスウェイの 比較と予測 未知を知る
パスウェイは 写像と集合の グラフ化だ
パスウェイは 首都高みたいな 情報網
パスウェイを 比較し機能を 予測する
パスウェイを 比較し探る 進化の秘密
ヒトゲノム ショットガンで 見てみたい
マジ頼む 忘年会で 忘れるな
メタゲノム 働き解析 謎明かし
メタゲノム あらゆる分野 応用できる
メタゲノム いたるところで 発生する
メタゲノム いろんなサンプル お任せあれ
メタゲノム サンプル使って 解析だ
メタゲノム ショットガンで 解析だ
メタゲノム すべての機能を 解き明かす
メタゲノム すべてまとめて かいせきだ
メタゲノム ドン、ドン、ドンと ショットガン
メタゲノム まだ見ぬ世界 そこにある
メタゲノム ミクロの世界に 踏み込むよ
メタゲノム 遺伝子プールに 大ダイブ
メタゲノム 遺伝子プールの 水質検査
メタゲノム 遺伝子プールを 解析だ
メタゲノム 解析の幅 広がるね
メタゲノム 環境守る 鍵を持つ
メタゲノム 去年の記憶 蘇る
メタゲノム 群集全体 理解する
メタゲノム 口の中には いっぱいだ
メタゲノム 周りにいつも いるんだね
メタゲノム 集メタ細菌 区別せず
メタゲノム 集団遺伝子 知るコード
メタゲノム 小さなものから 莫大に
メタゲノム 多くの微生物 難しいよ
メタゲノム 腸内環境 教えてね
メタゲノム 調べて機能を 解き明かす
メタゲノム 培養省く 必勝法
メタゲノム 微生物ことの ゲノムだよ
メタゲノム 微生物でも 解析可
メタゲノム 分割せずに 一括で
メチル化で BSブロック エピゲノム
メチル化で ちょっと寝ようと 遺伝子が言った
よく見ると パスウェイマップ 路線図だ
ラストだよ バイバイバイオ byバイオ
安定せず 時の移ろい エピゲノム
遺伝子の メチル化領域 Cが出る
遺伝子の 解析進む パスウェイで
遺伝子の 断片集めて ショットガン
遺伝子の 予測の手順 複雑だ
遠いかな テスト期末で 焦りなし
可変部が 変わらなければ みな家族
期末まで 日にちがあくのが 怖すぎる
群衆を まとめて調べる メタゲノム
今からなら 勝ち確テスト がんばろう
再履です これ落としたら 再々履
再履修 今日が最後と 願いたい
七回の 講義で上達 検索技術
就職で 修飾変わる？ エピゲノム
修飾で 遺伝子を超え 生物に
柔軟な エピゲノム的 思考持て
重い疾患 メタゲノム解析で リスク予防
親譲り エピジェネティクスが 語る縁
脱アミノ 変身シトシン ウラをシル
天然痘 スピリタスイッキ 殺菌だ
土の中 メタゲノムから 知る宝
到達度 どこまで詰めれる？ バイオ知識
培養が 不可なあなたも メタゲノム
発現を メタルで抑制 はい論破
微生物 めためたあるから メタゲノム
微生物 遺伝子プールで 増殖だぁ
微生物 解析するなら メタゲノム
未知の世界 メタゲノムから 浮かび出る
未知領域 縁の下の 酵素パワー
命の図 コントロールする メチル化で
６週目
1と0 使って表す プロファイル
1問で 検索機関 フル稼働
２数化す ネットワークは ブーリアン
2数値化で 変化したのか 分かるらしい
expacy 機構を知れて extacy
Expasy まるでペプチド 検索連鎖
ExPASy 思ってたより ページ過多
k-mean まるで真冬の 大三角
K-mean 難しすぎて What do you mean?
K-mean法 素早く計算 万能法
RNA 光る一瞬 写し出す
string 相互の関係 わかってく
uniprot 幾千万の 生命地図
Y2H 一を聞いて 十を知る
YBX1 癌マーカーに なっている
ああ無常 使いこなせない ツールたち
アトラスで 光るたんぱく かわいいな
いつの日か マイクロアレイ トライしたい
いつもある スライドの中に TOGO TV
オーソロガス 異種に宿る 同じ道
オーソロガス 枝分かれしても プロファイル
クオーター 年越しテスト 忘れそう
クラスター 遺伝子の比較 関連性示す
クラスター おそろ見つけよ 解析法
クラスター コロナもデータも 距離近し
クラスター コロナ禍地獄 蘇る
クラスター 遺伝子たちの 友好度
クラスター 遺伝子距離を レジスター
クラスター 効率的なの 非階層
クラスター 集いしものは 似て非なる
クラスター 仲良しまとめて 推理する
クラスター 発現パターン みえてくる
クラスター 閾値定めて 解析よ
クラスター解析 データから見えてくる 類似性
クラスター解析 遺伝子類似を 見つけ出す
クラスタ化 遺伝子君たち クラス分け
ゲノムから ロゼッタストーン 掘り当てる
ゲノムでの いろんな遺伝子 プロファイル
ゲノム配列 ショートリードで 先読みだ
こう言いたい マイクロアレイ あれいいね！
さまざまな 人のたんぱく 調べたい
シーケンス ゲノムの秘密 解き明かす
ジャンクション エクソン繋ぐ ファンクション
ショートリード ゲノム配列 マッピング
たくさんの 遺伝子調べる マイクロアレイ
タンパク質 データの森で あつまろう
タンパク質 プロテアソームで 丸裸に
タンパク質 プロテオームで 明らかに
タンパク質 筋肉細胞 活性化
タンパク質 分析しようよ エキスパシー
タンパク質 翻訳される RNA
タンパク質で いきものすべてを 作り上げる
データから パターン発見 クラスター
ネットから 遺伝子発現 比較する
ブーリアン 0か1かで わかりやすい
ブーリアン ネットワーク ０１で
ブーリアン 使えればかなり 有利じゃん
ブーリアン 閾値を超えて 見えてくる
プロテイン 生きる全貌 見せる道
プロテイン プロテオームで プロ解析
プロテイン 相互作用が working
プロテインと ゲノムを合わせて プロテオーム
プロテオーム タンパク質の 全容だ
プロテオーム 解析しあばく たんぱく質の謎
プロテオーム 解明するよ つながりを
プロテオーム 構造機能 解き明かそう
プロテオーム 細かい変化を 見逃すな
プロテオーム 比較検討 誰が為に
プロテオーム 理解できれば 無敵やな
プロテオームの 発現の様子 解析だ
プロファイル クラスター化で 分布見る
プロファイル 一個違いを 見つけよう
プロファイル 探偵みたいで かっこいい
プロファイル 分類進める 探偵団
ペアワーク タンパク質のように 協力す
マイクロアレイ 光るスポット 解析を
マイクロアレイ 点が多すぎ 目が痛い
マイクロで 見えた遺伝子 浮かぶ群
マッピング 解析するぞ さあどこだ
ロゼッタの 遺伝子比較で 解読だ
違いで 突き止めろプ ロテオソーム
遺伝子が 手と手を取り合い 作用する
遺伝子に プロテオームで 迫りよる
遺伝子の 機能解析 クラスター
遺伝子の 発現パターン クラスターで
遺伝子の 表情読む術 マイクロアレイ
遺伝子を プロテオームで 理解する
遺伝子を 解析解決 アルゴリズム
一目見て 遺伝子発見 クラスター
解析が いろいろあって こんがらがる
解析で タンパク質を 同定だ
解析で 発現遺伝子 まるわかり
解析で 利点も急所も まるわかり
解析の ぞれぞれの特徴 理解する
解析は 間が重要 エクソンの
解析法 変化捉えて 究明する
階層の 欠点補う 非階層
覚えたよ シングルエンド リード数
癌かもな マイクロアレイで はよ探せ
君色に マイクロアレイ 染めてみろ
個々データ 似たものどうしに グルーピング
光る点 マイクロアレイ 解く解析
今日の課題 英サイ2つ キツすぎる
最後まで 隣の人と ペアワーク
細胞の 交信受け取る 解析術
細胞の 働き解析 むずかしい
細胞のこと トランス、プロテで 調べるぞ
思考系 暗記なんかより やりやすい
実験で ゲノム解析 してみたい
種類越え ゲノムを比較 プロテオーム
酒まずい 消毒するぜ 火落ち菌
小テスト 生物工学で やったやつ
色により 量を測るぞ ていねいに
色付けて マイクロアレイ 識別す
色付ける マイクロアレイ 星のよう
新薬も マイクロアレイ お任せあり
生命の 秘密を明かす インフォマティクス
染まる色 遺伝の記憶 色褪せず
相関図 調べ尽くすよ ロゼスト法
測るたび 違う顔する プロテオーム
調べよう タンパク同士の 関係性
転写して がん細胞を 発見だ
転写の 流れをたどり 形見出す
謎のアレ マイクロアレイで 解析だ
年明けの バイオのテスト 気がかりだ
発現量 RNA-seq法で 明瞭化
発現量 遺伝子タンパク 相違あり
発現量 解析しよう RNA-seq法
発現量 知るには光量 マイクロアレイ
非階層 k-mean法で ランダムに
飛び込めば ゲノムの世界 新たな真
飛ぶ粒子 分かれる峰に 秘密解く
美しい マイクロアレイ 夜景かな
様々な 電気泳動 有用だ
洋服の チャックみたいだ ポリメラーゼ
類似性 クラスター解析 表すよ
５週目
Browserで Genomemapを 探索だ！
CGの 量で教える 転校生
DNA サンガー法で 解き明かす
GCの 数で見つける その個性
NGC 大量塩基 解析だ
NGS 塩基配列 導く鍵
NGS ゲノムサイズを 特定だ
NGS バイオの未来 切り開く
NGS みんなの遺伝子 調べたい
NGS 決めつけるのは 配列だ
ngs 新たな技術で 解析だ
UCSC 塩基配列の 類似性
UCSCで ゲノムの位置が 丸わかり
いろいろな 検索サイトで 腹いっぱい
イントロン スプライシングで はい、ドロン
イントロン 実は大事な 何かかも
エキソンは スプライシングで 密になる
エキソンを 選んで作る 多様性
エクソンが 組み替えられて 新たな形
クローニング 遺伝子のコピーを 作ります
ゲノム 比較により 配列の秘密
ゲノムが ショットガン法で 謎解ける
ゲノムって 何でもわかる 優れモノ
ゲノムには ドットプロット 有効だ
ゲノムには 生命の軌跡が 刻まれている
ゲノムをね 比較して探る 進化過程
ゲノム界 希望もたらす NGS
ゲノム決め 必要なのは コンティグだ
ゲノム見る 命の謎を 解く旅へ
ゲノム読み 遺伝子のページ 開く命
ゲノム読み 保存の鍵は 比較から
ゲノム配列 ショットガン法で 解析だ
ゲノム比較 ドットプロットで わかりやすい
ここにきて 川柳書くこと なくなった
サンガ―も 100台寄れば ショットガン
サンガー法 規模を大きく ショットガン
サンガー法 いろんな授業で でてくるぞ
サンガー法 キラキラ光る 波測る
サンガー法 ダイデオキシは いい発想
サンガー法 塩基配列 決定法
サンガー法 塩基配列 明かす道
サンガー法 塩基配列を 決定だ
サンガー法 光る塩基が 手がかりに
サンガー法 今現在でも 現役だ
サンガー法 上位互換 ショットガン
サンガー法 生物学研究の 源だ
サンガー法 地道な作業は NGSへ
サンガー法 波形のピークで 塩基決め
サンガー法 配列決定 するサンガー
シークエンス 解明決定 全ゲノム
シークエンス 生命の謎を ほどく糸
シーケンサ 脳裏によぎる すイエんサー
シーケンス 技術を駆使して 網羅する
ショートリード 配列リード 大規模に
ショットガン オーバーラップが ポイントよ
ショットガン ドン、ドン、ドンと ランダムに
ショットガン ランダム切断 乱れ打ち
ショットガン 塩基配列 打ち抜くよ
ショットガン 解析するよ ほぼコピペ
ショットガン 世代を超えて 増やしてく
ショットガン 打ってゲノムを 突き止める
ショットガン法 数撃ちゃ当たる 本当だ
シングルの 対はペアであり ダブルではない
シンテニー ゲノムの比較 進化的
どう違う？ シングルエンド ペアエンド
ドットプロット 見た目はまるで 流星群
ノーベル賞 二回取ってる サンガーさん
バイオの日 今日はちょうど 化学の日
ハロウィン シングルエンド 我散るよ
ヒトゲノム リピート配列 約半分
ブラウザで ゲノム配列 たしかめる
フレームで ゲノム予測し 機能探る
ペアエンド データを結ぶ 双子かな
ペアエンド ペアワークでも 使いたい
ペアエンド 隣5限で 俺エンド
ペアワーク 精度が高まる ペアエンド
ランダムに ゲノムさだめて ショットガン
ランダムに 切って見つける ショットガン法
リード知る シングルエンドと ペアエンド
リシークエンス 変異探知で 癌見分け
異常性 配列見つける 多様性？
遺伝子が どこにあるのか 確認だ
遺伝子が 進化の証 語りだす
遺伝子の 解析しかた 沢山だ
遺伝子の 配列知るには サンガー法
遺伝子よ、挿入欠損 何処へ行く？
一言も 話さず終わる ペアワーク…
一目見て ブラウザ越しに ゲノム知る
塩基さん 解析しやすく 色付けだ
塩基よむ シングルエンドで ターンエンド
塩基配列を、合成しながら読む、NGS
解析で ゲノムの特徴 見つけ出す
開始コドン ドンドンつながる アンチコドン
近縁種 ドットプロットで 比較する
見逃すよ ORFには 鍵となる
減点が 怖くてめっちゃ 考える
光りたい ピークを持続 精度よく
合わせ技 ゲノムのすべて 解き明かす
今日の授業 左後ろで いびきの音
最新の 配列決定 NGS
種と共に 進化していく 解析方法
瞬く間 データが揃う NGS
進化過程 比較ゲノムで 明らかに
進化的 保存を知ろう 比較して
正確に ロングリードで 読み取ろう
生物の 遺伝子予測し 特徴を知る
生物種 UCSC まるわかり
生物未履修 なにもわからず 祟りかな
西野研 みんなで笑って 頑張るぞ
染色体、異常がないか確かめる
全ゲノム ショートリードを ペアエンド
全ゲノム 見える化するのが 大事だね
多様すぎ 塩基配列 決定方法
大昔 ミトコンドリア 入り込む
短くても 決定できちゃう NGS
断片を 重なり会って 読み取った
抽出し 見えざるゲノムの 紐解けり
抽出で ゲノム特徴 明らかに
特徴的 GC結合 3番目
難しい 頭を抱える ゲノムだよ
配列から いろんな特徴 探し出す
配列の 決定のカギは 蛍光強度
配列の 決定方法 色々ある
配列を ドロップロットで 比較する
比較ゲノム 進化の軌跡 見えてくる
比較ゲノム 友達の進化を理解する
比較して ゲノムの歴史の 旅をする
比較して 進化過程 丸わかり
比較して 進化関係 明らかに
比較して 調べてみよう 何親等？
分かりたい ゲノム配列 その機能
変異から 進化の跡を たどり知る
変異だぜ ショットガンで ぶっつぶす
保存性 ゲノムを比較し 明らかに
予習して 最近授業が よくわかる
予測して 発見こいつは ORF
連続で 配列終始 読みたいぜ
４週目
20万も 構造わかるの すごいよね
5限のち みんな帰って アドレナリン
aiで、構造読み解き、ノーベル賞
AlphaFold 先に開発したら ノーベル賞
Aに〇 オングストローム はじめまして
BLASTの 使い方が よく分からん
PBD みんなで作った 電子辞書
PDB いままでよりも わかりやすい
PDB いろんな情報 集めてる
PDB タンパク質が 星の数
PDB タンパク質の KHY（解析・比較・予測）
PDB タンパク質を 調べたい
PDB 一つ二つと 増える数
PDB 科学者たちの 集大成
PDB 科学者たちの 集大成
PDB 過去の研究 積み重ね
PDB 鍵を握るは 四文字だ
PDB 構造の森 探検だ
pdb 構造解析 楽しいな
PDB 構造探しの 源泉だ
PDB 構造比較 知恵となる
PDB 今日もまた構造 明らかに
pdb 使い構造 解析だ
PDB 使って構造 明らかに
PDB 多様な構造 宝島
PDB 立体構造 更新だ
PDB 立体構造 写し出す
PDB 立体構造 探し出せ
PDB 立体構造 調べれる
PDB 立体構造 保存する
PDBで タンパク質の 形知る
PDBで 理解をしよう 立体構造
PDBで 立体構造 いざ探索
RSMD 計算地獄 おわらない
SCOP（スコップ）は 便利なツール ありがとう
SCOPで すくってCATH（キャッチ） 二次構造
SCOPで 分類分けて 広がる知
SCOPで 立体構造 掘り下げる
SCOPで 立体構造 掘り起こす
SCOＰに タンパク質が 載りすぎだ
アミノ酸 エナンチオマー 双子かな
アミノ酸 たくさんつなげて タンパク質
アミノ酸 たくさん連結 タンパク質
アミノ酸 配列似てたら 高精度
アミノ酸 離れちゃだめよ 見えないよ
おりたたみ 1000個もあれば アコーディオン
グルタミン 1文字表記 Qになる
ここでもか エナンチオマー ひさしぶり
スコップで 二次構造を 解き明かす
タンパクの 構造重ね 分析す
タンパク質 いっぱい知ってる PDB
タンパク質 みんな違って みんないい
タンパク質 簡単そうで 複雑です
タンパク質 構造解明 ノーベル賞
タンパク質 構造予測 種類多様
タンパク質 静同相互 正負分け
タンパク質 働き決める 立体構造
タンパク質 分類使って 活用だ
タンパク質 立体構造 PDB
タンパク質 立体構造 明確に
タンパク質 立体構造を分析 機能も知る
タンパク質の 立体構造調べる PDB
ちゃんとした Φとψを 組み合わそう
データの海 泳ぐ分子を 解き明かす
トポロジー 君と僕との 共通点
バイオの日 更新される PDB
パソコンで(P) データ収集(D) ぼく得意(B)
プロテイン 異常フォールド プリオン病
プロテイン 構造で機能 予測する
プロテイン 世界に芽生える 水曜日
ポテンシャル 分子も友も 相互作用
ホモロジー 似たものヒントに 構造予測
ホモロジー 数値で感じる シンパシー
ホモロジー 調べたいなら CATH使おう
モデリング 見えないものを 見ようとして
ラマチャンド 逆から読んで ドンチャマラ
ラマチャンドラン 色濃い方が 安定です
ラマチャンドラン 生化学でも 要チェック
リボンモデル 赤い部分は らせん状
握手したい 叶わぬ願い エナンチオマー
解析は データの山に 道見出す
強すぎる アルファフォールドは 次世代だ
教えてよ あなたの構造 SCOPで
鏡見て エナンチオマー 君と僕
鏡像に うつるかたちは 偶像で
検索で 時が止まった 2023の1月
原子を点 分子動力 何してん
構造が 22万も 知らぬ間に
構造が どれだけ似てるか 比較しよう
構造が 非常に似れば ファミリーだ
構造から 分かったポケット 役立てよう
構造で 変幻自在の タンパク質
構造の 予想で未来 予測する
構造は PDBで 丸わかり
構造を まだまだ蓄積 PDB
構造を 解き明かすごとに ヒント得る
構造を 開けば広がる 命の図
構造を 知りたくなったら PDB
細胞と タンパク質と 君思ふ
細胞間 シグナル伝達 命の道
三次元 構造わかる PDB
四文字の アルファベットが 多すぎる
思ってた 倍奥深い タンパク質
柔らかく タンパク質が ゆらいでる
小テスト 時間がかかり 日が暮れた
情報で わかるあなたの 共通点
情報は 配列だけでは 物足りない
色分けで 配列比較 わかりやすい
神秘的 タンパク質と アミノ酸
親友は 自分の鏡像 異性体
西野研 笑いのレベルが 古細菌
折りたたまれた 折り紙のような タンパク質
先人の 宝庫を探る バイオの検索
大文字の アミノ酸は まぎらわしい
電子で 壊れる脆い タンパク質
登録数 調べる度に おい変わる
頭の代わりに 回ってくれよ タンパク質
同じでも モデルの違いで 別印象
二次構造 マップで解析 領域図示
二次構造 ラマチャンドランで 可視化する
二郎にて ラマチャンドランプ ロット乱し
日々更新 PDBも みな同じ
熱で変わる タンパク質は 柔らかい
配列が ２０パー一致 維持できる
微細な差 PMSDで 測り知る
物体の 立体構造 複雑だ
偏りで 制約受ける タンパク質
僕たちは 応援得意 酵素だよ
僕にはネ S（評価）が取れない Mだから
膜を越え 螺旋解けゆく 時の謎
目の中に コンタクトマップ 入れづらい
揺らいでも 立体構造 特定だ
揺動よ 構造変化 柔軟だ
洋サイト 四回目にして 慣れ始め
立体で みえたらさらに 分かりやすい
立体構造 詳しくは PDBで
立体構造 平面で描く マップ分析
立体図 綺麗だけど 意味わかんない
類似性 見つける手段 二次構造
Φとψ タンパク質の 宝地図
３週目
BLASTして 見つけた遺伝子 友となる
CLUSTAL 忘れないうち 課題解く
Clusutal 配列用いて 検索だ
M・I・D 隠れマルコフ 便利やなぁ
SPスコア 重み付けで 遠縁配列
SPスコア 数えたそばから すぐ忘れ
アミノ酸 配列読みとり はじめよう
いきものの アラインメント うつくしい
オートマトン 難解すぎて 考える
かくれみの 遷移確率 マルコフだ
かくれんぼ マルコフモデル みーつけた！
かわいいな 隠れマルコフ ゴロいいな
キラキラと 輝く私は クラスタル
クラ・オメで 1発判別 分子距離
クラスタル おめぇがやっぱり さいきょうだ
クラスタル 使って解析 おもしろい
クラスタル 配列比較 分かりづらい
クリオメを 使いこなして 距離を知る
シーケンス 隠れマルコフ お見通し
スコアへの 計算いろいろ むずかしい
ツール使い 生命の謎を 解き明かそう
ディズニーで 隠れマルコフ 見つけたい
データの陰 マルコフモデルで 明るみに
でてこない 仕事しなさい ブラスト君
バイオでも マルコフモデル 活躍だ
バイオはね 配列コピペ おおくなる
ハマダラカ 何を運ぶの マラリアか（蚊）
ひさしぶり またまた活躍 ブラストさん
ひとつずつ 計算すれば 答え出る
ファミリーで 酵素活性を 保存しよう
プロファイル 計算多すぎ けたましい
ペアワイズ 22番の ペアわいです
マルコフ 生物応用 おどろくよ
マルコフさん 隠れてないで 予測して
マルコフさん 解析学で 有名人
マルコフさん 確率研究 成功だ
マルコフさん 株価を予想で お金持ち
マルコフで DNAを 推測だ
マルコフで 隠れた真実 予測する
マルコフで 隠れ欠失 見つけよう
マルコフで 人の本心 聞いちゃうぞ
マルコフと マルコフニコフ 別人よ
マルコフの 隠れた可能性 手掛かりに
マルコフは 化学と生物 つないでる
マルコフよ 隠れなくても いいコフよ
マルチプル コロナを解析 変異株
マルチプル 工夫をこらせ タクティクス
マルチプル 配列比較 簡単に
もうすぐだ BLASTマスター なる日まで
遺伝子は 進化の記録 解くパズル
遺伝子を 整列させて いざ探索
一つでも 配列増えると 大変だ
隠れても とても役立つ マルコフさん
隠れても マルコフモデル 仕事する
隠れてる ニコフじゃないよ モデルだよ
隠れてる マルコフモデルで 見つけ出す
縁がなく だがモチーフは 同様だ
遠縁に 重みを付けて スコア付け
可能性 マルコフモデルが 増幅する
解析に 欠かしてならない ClustalOmega
確率の 背後に潜む 事象知る
近縁も 遠縁だって 丸わかり
君と僕 SPスコア いくつかな
君のこと解析しちゃおうマルコフで
系統樹 omegaを使えば イチコロだ
系統樹 アラインメントで 作りたい
系統樹 たどって出会う 我が先祖
系統樹 書くのは難だが 美しい
系統樹 数大きいほど 遠縁よ
系統樹 生命の進化 結合す
計算で 進化の軌跡 分かるんだ
計算量 減らして目指せ 効率化
欠席多 病か疲れか 推し量る
結果から 隠れた条件 予測する
検索の サイトはせめて 日本語で
見つけるぞ 置換をたどれ 進化距離
見つけ出す SPスコアで 遠縁を
工夫して 複数比較 マルチプル
行列で 塩基配列 見つけ出す
細胞の タイムマシーン iPS
使い分け 2つもあって 難しい
使ってみた マルコフモデル 有用だ
事象のみ 観測可能 隠れマルコフ
似ているか 数値でわかる スコア法
次を読む マルコフモデルで 選択肢増
種の近遠 アラインメントで 探し出す
重み付け SPスコアの 誤差軽減
重み付け SPスコアの 必殺技
重み付け 遠縁配列 見つけ出す
重み付け 遠縁配列 探索す
重み付け 新たな知識 保存する
重複の 読み方で分かる 生か物か
照れ屋さん はっきりしてくれ マルコフさん
身近にも 隠れマルコフ 隠れてる
進化距離 僕と先祖は 離れてる
生物の ロマンを連ねる アラインメント
生物の 類似性を 数値化し
前回の 内容忘れて おい撃沈
相同性 ある奴贔屓 重み付け
相同性 色んな仕方で 見つけ出す
他分野に 活用できそう マルコフモデル
大事なの 変化しにくい ところほど
提出だ！ 出そうとしたら 期限切れ
天気予報 マルコフモデルで 正確に
二次構造 アラインメントで 予測可能
配列が まじ長すぎて 画面外
配列が 語る物語 スコア次第
配列で SPスコア 重み付け
配列で 畳みかけてく TATAボックス
配列で 進化の過程 分かっちゃう
配列で 進化の足跡 見えてくる
配列の 近縁遠縁を分析 進化の経路
配列の 計算減らして 楽々だ
配列は マルコフモデルで 解析よ
配列を 解析進め 探し出す
配列を 調べてわかる 特異性
配列を 比較してみて 解析だ
配列を 比較し縁を 探し出す
配列を 比較し系統 解析だ
配列を 比較するには 工夫する
比較する アラインメント ツリーベース
不可能を 可能にしていく 新技術
分岐した 配列求めて 効率化
分子時計 たどれば祖先 わかるかも
分子時計 生命の進化を 遡る
分子時計 静かに語る 過去の道
保存列 活性残基を 推定可
問題の 隠れマルコフ いいジョーク
嵐でも 隠れた君に 会いに行く
隣席 生物選択 より結託
累進法 間違え防いで コスパよく
累進法 時が明かす メカニズム
累進法 進化の軌跡 見つけ出す
累進法 配列比較 めちゃ速い
累進法 並び間違い 防いじゃう
類縁の キミを繋ぐ 進化の遺伝
類似性 SPスコアで 見つけよう
恋人も 累進法で 見つけたい
２週目
ATGC 4つの文字が 生命線
BLASTで アラインメントを 比較しよう！
BLASTで ゲノムの謎に 挑戦だ
BLASTで ゲノムわかれば みな親戚
BLASTで タンパク質を searchする
BLASTで 塩基配列 すぐ分かる
BLASTで 塩基配列 解析や
BLASTで 塩基配列 確かめる
BLASTで 気が合う仲間 探したい
BLASTで 語学の壁に 阻まれる
BLASTで 詳しくわかる 気持ちよし
BLASTで 情報繋ぎ 解き明かす
BLASTで 進化の過程 読み解いて
BLASTで 進化の謎を 解き明かす
BLASTで 全ての情報 獲得だ
BLASTで 頭がblast 情報過多
BLASTで 謎の生物 解き明かそう
BLASTで 配列打ち込む 理科大生
BLASTと FASTAの違いが ややこしい
BLASTの どこでさがすか わからない
BLASTの 解析時間 長かった
BLASTの 素早い計算 便利だな
BLASTの 配列解析 高速だ
BLASTは 解析できる プログラム
BLASTは 高速比較の 便利屋さん
BLASTは 最も広く 使われる
BLASTは 使い分けがね 肝なんだ
BLASTは 精度劣るが 速度速い
BLASTも、もちろんFASTAも 都合良い
DDBJの 見方がホント 分からない
FASTA アラインメント 荒いんよ
FASTA 検索重ねて 雨上がる
アミノ酸 わかれば 生物分かっちゃう
アミノ酸 機能の変化 進化です
アミノ酸 使ってワクチン 作成だ
アミノ酸 配列データ 多すぎる
いにしえの ゲノムの秘密 解き明かす
エレガンス センチュウどこが エレガンス
サピエンス 進化したのに 親知らず
サフィックス 似たもの同士で まとめるよ
スコア見て 似たる配列 浮かびだす
タンパクの ダンスが織りなす 生命の舞
タンパクを 生成分析 わかる祖先
タンパクを 比較によって 解き尽くす
データでの 配列比較 分化知る
データベース 蓄積続く 知の結晶
どこを見る オンリーワンと 類似性
とりあえず 配列比較 これ基本
バイオから 紐解く過去に 不思議あれ
バイオの実 データの海で 花開く
バイオ世界 配列比較 基本だよ？
ハッシュ法 配列比較は 基本のキ
ぱっと見じゃ 塩基配列 呪文だよ
ファストエー 斜線流れる 流星群
ブラスタも ブロスタさんも Supercell
ブラスト かけてもエラー 飛ばすぞ
ブラストで 塩基配列 見つけたり
ブラストで 早めに検索 塩基配列
ブラストは 一文字違うと エラー出る
ペアワーク 仲深まるし 知識増す
ペアワイズ あなたと私 マイナス点
ペアワイズ 君のとなりに 僕がいる
ペアワイズ 並べてみれば 似た違い
むずかしい 克服するぞ パブメドを
やりやすい BLAST検索 入れるだけ
らせん上 ATGC 舞う塩基
依る先は 歴史と命の ライブラリ
遺伝子の 重複示す 先祖かな
遺伝子の 配列解析 未来開く
遺伝子の 配列調べ 解き明かそう
一緒なの！？ 調べて分かった 同じ祖先
一致した 鎖の間に 系統樹
塩基対 検索するだけ 俺分かる！？
横文字が いっぱいあって むずかしい
解析で 進化の足跡 解き明かせ
解析の 我らの辞書は BLASTだ
解析は 生命（いのち）の重さ 身に染みる
基本だよ 配列もとに 比較する
泣かぬなら 解析しなきゃ ホトトギス
検索で ミクロな世界を 深堀りだ
見えてくる 進化の流れ 遺伝学
見つけ出せ あの子と私の 相同性
見つけ出せ 俺(ヒト)とお前(その他の生き物)の 共通点
高速で アラインメント BLASTさん
高速で 検索するのは blastさ
高速化の 礎となる ハッシュ法
合わないな アラインメントの 計算が
困ったな そんな時には BLASTだ
最大の アライメント経路 探し出す
最大値 辿り着くまで 一苦労
種の起源 タンパク質から 紐解こう
種分化で 相同タンパク つくりだせ
重複で 配列かわる 祖先から
小テスト わからなすぎて おい泣ける
小テスト 協力し合って いきたいな
進化の道 たどるため 比較する
人間と ネズミの遺伝子 相同だ
人生も BLASTで良い ものだけに
生物の 歴史すべてを 解読し
生命の 配列データ 大事だね
生命の 配列ながめ 歴史しる
生命の 分岐をたどり 謎明かす
精度より 速度が命 BLAST神
前の席 迫力満点 緊張だ
祖先をね たどればほらね 同じかも
相同性 分化の歴史の ヒントだね
体内の 転写翻訳 健気だな
待っていろ 解析マスター なってやる
第二講 どこにも答えが あれへんな
誰だっけ？ 頼りになるは 座席表
地道すぎ 動的計画 名前だけ
注意しよう 少し配列 違うかも
長すぎて 解けない塩基と 縁切れる
同じでも 種分化先で 変わる顔
突然の 変異が導く 種分化へ
配列が 我らに告げる 歩みの史
配列が 示し導く 進化とは
配列で 種類特定 つながりを
配列で 進化の糸を 紐解こう
配列の スコアがずっと あわないな
配列の 計算問題 要注意
配列の 神秘もデータに なるこの世
配列の 比較行い スコア見る
配列は スコアをつけて 比較する
配列を アラインメントで 精密に
配列を アラインメントで 比較する
配列を サイトで探せば 効率化
配列を 組み分けてけば そうどうだ （騒動・相同）
配列を 探究すれば 見える道
配列を 比較するのが 基本のキ
配列を 有効検索 FASTA
配列情報 解析して辿る 生物起源
配列比べ 遠く近くも BLOSUMで
配列比較 動的計画法（ダイナミック）に 最大値
並びたる 配列で見る 軌跡かな
目に見えない コードで繋がる 異生物
問５番 解いてブラストに 感謝する
理科大は 抽選多い 運頼み
理科大生 実感できる 水45限
１週目
「生物を いろんな視点で 解析し」
2回目も 結局これは わからない
3Qは バイオインフォで 検索だ
BLAST走り 似てる配列 探し出す
DNA わずかな差異で 多種多様
DNA 解析するため 頑張るぞ
DNA 私のすべてを 握ってる
PubMed 今は見るだけ いつか載りたい
Pubmedで 検索したら 一致なし
Pubmedで 検索するも わからない…
PubMedで 読みたい文献 探し出す
PubMedの 日本語ページ 出て欲しい
PubMedは 先人の成果だ ありがとう
Pubmedは 努力と知識の 宝庫である
いきものは インフォマティクス かわいいね
いつだろう バイオの授業に 慣れるのは
いつの日か 遺伝子変異 解き明かす
グーグルで 多様な論文 読み漁る
ゲノムには 夢が詰まって詰まって 詰まってる
ゲノム読む 遺伝の謎に 道ひらく
ことしこそ 習得してやる PubMedたち
この授業 生物だらけで 大変だ
しぬまでに 論文投稿 してみたい
しのぶれど 色にいでにけり DNA
スペルミス バイオよりまず 英語でしょ
タグ付ける ハッシュタグより かぎかっこ
データ群 眺めればまた 謎めいた
テグス編み つくったアクセ クロマチン
ドライヤー シャワーしたのに 汗かくよ
なにをする ドロンとなくなる イントロン
なりたいな すごい論文の 1au
ネット上 数ある情報 見つけ出せ
バイオイン 教室インで むずすぎん
バイオも受け ３回習う 遺伝周期
バイオ学 いのちの地図を 見渡して
バイオ技術 生命の謎を 開く扉
パブメッド 横文字多い わけわかめ
パブメドで 欲しい論文 ゲットする
パブメドに 人生かけて いざ勝負
パブメドや 終わる目処なし 知の探求
パブメドよ ぼくの論文 のせてくれ
ビッグデータ 君の身体に 詰まってる
ヒトゲノム 初全解読 それ誰の？
プロテイン タイミーよりも 勝手いい
ペアワーク 2年生なの はずかしい
ミスドさん プラスミドーナツ 頼みます
やり抜くぞ 気合いの遺伝子 活性化
ランダム席 授業落とし 友増える
ワトソンと クリック発見 二重らせん
意外だね バイオとデータの 組み合わせ
遺伝子で 我らの未来を 照らし出せ
遺伝子の 親子のバトン 続いていく
遺伝子よ 未来語るは タンパク質
英語からは 逃れられない PubMed
英語力 まだまだ必要 PubMed
科学的 論文を調べる 結果出す
解析し 遺伝の謎を 解き明かす
解析し 生命の謎 解き明かす
解析し 生命神秘 解き明かす
解析や 命の輝き 解き明かす
回り見る 明らか違う 面構え。
懐かしい かすかな記憶が よみがえる
核からの 小さなお手紙 RNA
求エキソン ゲノムの山を 解析す
協力と 苦労の先に 笑いあり
教科書で，信頼性を，高めよう。
金欠は PCRで 即解消
検索し 生命科学 網羅する
検索で ANDとORを 間違える
検索の 仕方難し ギブアップ
検証は 結果出すため 時間いる
研究は ソースの正しい 資料から
現代の 情報駆使し よき学び
広くから しぼっていこう パブメッド
考えて！ プライバシーだよ マイゲノム
今年こそ pubmed 検索 マスターに
今年こそ 単位を取らなきゃ 留年だ
再履修 去年の授業を 懐かしむ
再履修 臨む姿勢が 別次元
犀利です 今年こそは 理解します
指定した 論文検索 Pubmed
治療法 発明します データから
初めての 論文さがし 難しい
初授業 課題の質が 重すぎる
初日から かなりやばいお ルーレット
小テスト みんな終わらず 5時限目
小テスト 昨年同様 超苦戦
情報で いのちのロマン 解き明かす
情報と 生物学の 交雑点
情報を 駆使し生命の 未知探る
情報を 正しく集めて 有効活用
真実を 確かめるため 仮設立て
人類の 明日がかかった 情報だ
生き物の 未知の世界は おもしろい
生科基礎 日本の未来 担ってる
生物と 情報科学で 新発見
生物の インフォでつかむ Whole New World
生物の 地図を探りて 解き明かす
生物は モノを知らねば 始まらぬ
生命の 輝きを知る 四時間目
生命の 情報解析 大変だ
生命の 情報集まり 解析だ
生命の 潜在能力 無限大
生命の 謎に迫って 秘密知る
生命の 謎を解き明かす 一つのカギ
生命を アルゴリズムで 解き明かす
生命情報で 塩基配列 明確に
席順と 塩基配列 めちゃ大事
川柳が 分からないから 寝ることに
総説は データを基に 新視点
総説は 既存の文献 まーぜまぜ
大谷さん 共通点は 二刀流
探究者 ミクロ世界と にらめっこ
調べるの 英語ばかりで わかんない
提出が 本日中なの なあぜなぜ
当てちゃうよ 君の論文 そのぜんぶ
二重らせん 解き結ばれ 向かう明日
二重らせん 秘めたる情報 交差する
入門で 心が折れる pubmed
任せなよ 論文こちら パブミッド
脳みそを クローニングで 増やしたい
背水で 緊張漂う リベンジ's
配列が 長くてむずい 集合体
複雑な 命の構造 紐解いて
複製の 複製フォーク 可愛いな
文献を 検索しても エラーコード
未知を行く バイオを学ぶ Pubmedと
理(R)科の知で ナ(N)ノ医薬品 AUG
隣人と 落単回避 奮闘す
論文で 文献データ フル活用
論文と 総説違い 理解した
論文と 英語が苦手 成績D
論文の 検索の文字 暗号だ
論文の 情報収集 pubmed
論文は 著者の努力の 結晶だ
論文より テストの過去問 探したい
論文を すべて見るころ 寿命かな
論文を パブメドで楽に 検索だ
論文を まとめて調べて 新たな知見
論文を 簡単に検索できる すごい時代
論文を 検索してみた かっこいい！
論文を 探し読むには 探し方
論文を 読みまくったら めまいする