染色体構造生物学 西野研究室
Chromosome Structural Biology Nishino Laboratory
2025年度バイオインフォマティクス川柳
８週目
７週目
６週目
５週目
AIも 読めない配列 ロマンあり
ATG 間違えたなら 初めから
ATGC 羅列に聞いた 君の名は。
AT偏り 複製点にみえる 軌跡かな
NGS (N)長い(G)ゲノムも(S)速攻で
NGS 07だよね！ 次世代です
NGS コードが示す 真の姿
Oh my God! ゲノムの緻密さ うつくしや
ORF 6フレームで 見つけ出す
UCSC 染色体を どこまでも
UCSC ゲノムの軌跡 うつしだす
UCSC 色とりどりで 目が泳ぐ
UCSC 図や情報が いのちだぞ
UCSC 他種のグラフが バーコード
アセンブル パズルみたいで 大変そう
いつだって スキマを埋める イントロン
いつの日か 全てのゲノム わかるかな
イントロン 飛ばして残る 命の詩
クリックして 謎が深まる アノテーション
ゲノムさん わたしの情報 全握り
ゲノムでは 1パーセントで 大違い
ゲノムみて 恋の遺伝子 探しけり
ゲノム間 比較して知る 祖先たち
ゲノム見て 何がなんだか わからない
ゲノム見る 自分の過去も バグだらけ
ゲノム見る 推しの遺伝子 尊みMAX
ゲノム知り 自分の遺伝子 シーラカンス
ゲノム読む 機械と人の 共同作
サンガーで ゲノム調べる むずかしい
サンガー法 800塩基で 決定だ
サンガー法 ピークを読み取り 数値化だ
サンガー法 蛍光波形が 美しい
サンガー法 光に照るる 命かな
サンガー法 今日も震える ピペットが
サンガー法 波形で見える 塩基たち
シーケンス 技術がだんだん 上昇中
ショットガン 名前も技術も かっちょいい
シングルか ペアかの選択 人生も
シンテニー 感じる心は シンパシー
シンパシー 感じる領域 シンテニー
たくさんの 情報載ってる UCSC
ドット打ち 似てるとこ見て つながって
ヒトゲノム 0.1％のみが 多様性
プロットで 共通祖先 浮上する
ペアでなら 解決できるさ なんだって
へたっぴも 数撃ちゃ当たる ショットガン
マンネリ化 待ったなしかな ペアエンド
ミント香る 遺伝子たちの 秘密の森
リードして わたしのゲノム 読みたいなら
遺伝子の 電車に乗って 未来へと
遺伝子の 特徴分かる 新世代
遺伝子の 未知の機能を 明かしたい
遺伝子の 予測で想像 未来の地
遺伝子を 比較して知る 進化の輪
遺伝子を 予測しながら 時を知る
一文字で 世界が変わる 塩基かな
塩基よ 光って流れ 夜が更ける
塩基列 ノイズの中に 光あり
塩基列 解析するのに 何選ぶ？
解析だ ゲノム配列 次世代の
解読法 旅は続くよ どこまでも
嬉しいな 細胞解明 ノーベル賞
機能をね 調べてわかる ゲノムから
居眠りの 遺伝子発現 制御したい
繰り返し 配列よりも 試験地獄
君と僕 ドットプロット 重なった
君のこと 知りたくなって ゲノム見る
蛍光が 読み解き教える 4つの文字
蛍光で 分かるのまるで 蛍だね
検索の サイトが多すぎ 大変だ
見てみよう ゲノムの配列 サンガー法
賢くね 塩基配列 決定よ
行く先も ゲノムが知ってる かもしれない
高速で ゲノム解析 ショットガン
再編成 一つ足せば 見えてくる
斜め線 似てる命の 証かな
終止コドン TAG(タグ)付けされたら 終了だ
小さくも つなげば見える 生命図
少しずつ 解き明かされる 共通祖
進化過程 ゲノムを比べて 見えてくる
人間は 遺伝子予測で 出番なし
生物を モノから文字へ 可視化する
生命の すべてが詰まる ゲノムデータ
切り開け 未来への希望 ゲノムから
絶滅しても ゲノム塩基で 蘇る？
染色体 長いよ長い どこまでも
線虫の 遺伝子の数 マウス超え！？
組み合わさる 塩基の羅列 摩訶不思議
断片が 語る全体 ゲノム地図
読み込みで 悲鳴を上げる パソコンかな
猫と犬 ゲノムはどれだけ 違うのか
波形知り それで満足 していいの？
配列の 1文字ずつ 歴史書く
配列は ショットガンで 決定だ
配列を ショットガン法で 乱れうち
配列を 光の色で 特定だ
反復をロングリードで読み取ろう
比較して 機能を知れる 次世代で
並べるよ 塩基配列 シーケンス
膨大な ゲノムの中の 秘密探す
未知の機能 解明したら ノーベル賞
明かそうよ 比較ゲノムで この進化
様々な ゲノム配列 解析法
螺旋より 深き進化の ログを読む
曖昧な 蛍光強度 どうしよう
⽐較ゲノム ゲノムのしんか あきらかに
４週目
1Åの ズレにも宿る 構造差
20種が 組み合わさって 生命線
HIV-1 月下美人な 花畑
PDB 構造暴いて 花開く
PDB タンパク質の 収納庫
PDB データの数で 時を知る
PDB 解き明かされた 三次元の世界
PDB 数増えるほど 新発見
PDB 理想の相手と マッチング
PDB 立体構造 丸わかり
PDB 立体配置 詰まってる
PDBで 自分の仕組み 知れるんだ
PDBで 立体構造 見てみよう
PDBには 人類の叡智 詰まってる
RMSD 耳元囁き それASMR
RMSD ズレに進化の 痕を見る
RMSD 全体偏差 お見通し
RMSD値 二乗と足し算 過酷です
SAVASの中 PDBで みてみよう
SCOPで タンパク質を 掘り起こす
アミノ酸 BLASTにかける 手間かかる
アミノ酸 一つの大きさ 0.5ナノ
エブリデイ 新たな構造 見つかってる！
カラフルな 矢印いっぱい PDB
シス側は 困難だから トランスフォーム
その座標 生命の謎が 眠ってる
ダイエット プロの手の中 プロテイン
タンパクと 人工知能 ノーベルよ
タンパクの 家系図ひもとく SCOPだ
タンパクの 構造データ 見れるよね
タンパクの 情報の宝庫 PDB
タンパク質 AI使って 丸わかり
タンパク質 形違へど 肉は肉
タンパク質 構造バイオで 解明だ
タンパク質 食べるも作るも 触媒も
タンパク質 人間関係 より複雑
タンパク質 服を着てても 見透かされる
タンパク質 揺らぎや動き 役にたつ
タンパク質、予想すれば、当たるかも
タンパク質の 原始座標は PDB
データ山 重ねるほどに 謎ふかし
どうしよう 何もわからない テスト怖い
トポロジー ドーナツ・クランプ 同じかな
ドメインが 肩寄せ合って 語り合う
プロテイン 牛乳割りしか 要らないな
プロテイン 形が命の 分子だよ
プロテイン 構造集める データベース
プロテイン 目には見えない 複雑さ
ペプチドの 構造色々 あるんだな
ヘリックスと シートで描く 生命美
ユーナジー 二ホンウナギの 機能美や
ゆらぎます タンパク質と 体重が
ラテン語で 雰囲気出るよ ab initio
一筋の 鎖が結ぶ 世界かな
一行に 生命の謎が 潜んでる
飲んでみよう PDBの プロテイン
宇宙人 もし出会えたら ブラスト検索
顔洗い 鏡の自分は エナンチオマー
求めよう 君と僕との ディスタンス
筋肉を デカくするなら プロテイン
鶏むねで タンパク質を 補給する
研究の 根幹を担う PDBかな
研究を Foldit 協力だ
現代人 タンパク質取っている人 偏っている
更新日 水曜九時に 目が覚める
構造が 複雑すぎる プロテイン
構造で 性質決まる プロテイン
構造と 共に増えてく 皆の希望
構造の 隙間に薬が 入るかな？
構造は 機能の理由（わけ）を 語り出す
構造を 登録しよう PDBに
構造を 覗けば宇宙 PDB
構造を 夢に描いた PDB
構造を 予測できたら ハッピーね
酵素とね 基質の絆 求めよう
今を結ぶ 命の糸の 積み重ね
三次元 構造予測で 生命読む
似て非なる エナンチオマー 個性あり
重ねれば 血の繋がりを 感じ得る
照らし観る 構造ゆえの 多様性
象細胞 即アポトーシス 癌回避
信じてる 私とあなたの ホモロジー
折りたたみ 命が宿る たんぱく質
折れたたみ 偶然じゃない 必然だ
折れ曲がる 鎖の隙間に 生命あり
先駆者の 検索ツール 続く歴史
同じかも 君と私の 二次構造
二次構造 三次構造 四次構造
配列の 一致度次第 何もかも
半熟派 揺らぐ構造 ゆで卵
分⼦動⼒学 タンパク質動き 計算します
変性し 元に戻れず 時間たつ
僕と親 DRMS必須の 関係だ
命とは 働き続ける プロテイン
友達と 二人三脚 小テスト
予測して これで私も 三次元
予測して 当たるも外れるも ab initio
予測には 配列・構造 フル活用
予測より 先に崩れる わが構造
立体が 働き始める タンパク質
立体図 求めて目指せ ノーベル賞
類友を 巡り合わせる PDB
α巻き βで支える 生命美
３週目
BLOSUM お見合い前の 相性値
Clustal 意外な親戚 分かるかも
DNA 2本で1つ 深すぎる
SPスコア 計算できる 理大生
TとA 交互に並んで プロモーター
アミノ酸 一つで変わる テスト点
アルファベット 並べてできた このわたし
イカサマも 隠れマルコフ モデリング
いろいろな 配列比較し 系統樹
ギャップ入れ 人生にもね 必要さ
クラスタル 英語が多すぎ クラクラしたる
クラスタル 照らしてわかる 類似性
クリスタル オメガが時計に 文句言う
こびとづかん カクレマルコフ かわいいね
スコア表 チマチマ計算 楽しいな
たくさんの 候補あるなら プロファイル
ツリーベース 友の枝先 俺いない
データ越し 菌の鼓動を 聴く夜かな
ブラストに クラスタルオメガ 訳わからん
ペアワイズアラインメント ペニーワイズより 怖いです
マルコフさん ギャップと共に 隠れてる
マルコフで 観測できずも 意味を読む
マルコフで 配列の謎 推理しよう
マルコフの より確実な 占いかな
マルコフモデル 使わずわかるよ 君のこと
マルコフや どうしたポッター いやそれマルフォイ
マルコフや 隠れてないで 出ておいで♡
マルコフよ 隠れてないで 出ておいで
マルコフ氏 隠さないでよ いじわる♡
マルコフ氏 今日は傘を 持ってくの？
マルチプル アラインメントが 難しい
マルチプル 似たもの同士 ペアワイズ
マルチプル 動的計画 適さない
マルチ組み 君と配列 ずれまくり
みとめたい 個性溢れる 塩基の差
もういいよ 隠れマルコフ みいつけた
遺伝子を 回してそろう ガチャの運
隠れても 確率だけは 揺るがない
隠れてる でもバレちゃうよ データ君
隠れてる 事象を推測 マルコフさ
隠れてる 状態推定 隠れマルコフモデル
隠れマルコフ 名前がなかなか かわいいな
隠れるな 全てを晒せ マルコフよ
遠縁を クリスタルで 見つけたい
音もなく 進化は今日も 置換する
我々の 進化を見守る 分子時計
解析で 秘密の機能 見つけ出す
解析は 工夫しないと 待ち侘びる
確率で 語の裏には 状態が
確率で 状態導く マルコフさん
確率で 選定しちゃう マルコフだ
確率で未来を覗くHMN
楽しいね SPスコアの 計算が
君と僕 知りたい違いに 重みづけ
系統樹 見た目で作ったら 配列似てないことも
系統樹 枝はもっと 伸びるかな
系統樹 線で繋がる 遠い種と
計算を 楽にするのは 累進法
計算量 増えすぎ注意 マルチプル
検索で 最高尤度を 見つけたい
見えずとも 予測をすれば 見える科学
見えぬもの マルコフモデルで 予測する
見えぬもの マルコフ使い 探り出す
見えぬもの 確率たどり 解を探る
現実で マルコフモデル 役に立つ
古池の 蛙だけでも 7000種
困るのよ コンピューター 君なしじゃ
使い方 どんどんマスター していくよ
似てるけど ほんとに同祖？ アラインメント
似て非なる 塩基たちにも 絆あり
時はかる DNAにも 時計あり
時間がね 無くてできず 川柳が
授業中 スコア計算 寝落ちする
樹を揺らす 重き遠くの 枝葉かな
樹状図の 美しきに見ゆ 進化の轍
重みづけ したら分かるよ 遠い親戚
重み付け SPスコアの 差別化を
重み付け 遠縁推定 楽になる
重み付け 遠縁配列 近付ける
重み付け 塩基の遠近 明らかに
重み付け 結果はいつも 主観的
重み付け 進化の歴史 探るカギ
少しのね dnaの違い 大きいな
状態が 未来の確立 変えていく
親戚が アラインメントで わかるかも
進化をね アライメント してみよう7
進化距離 歴史の重みを 考える
進化先 アラインメントで わかるかな
多重置換 多様な命の 源泉だ
大谷も 遅ればせながら ツリーベース
第三回 早くも意味が わからない
探せ 存在確率マルコフモデル
超ラッキー 隠れマルコフ 見つけたよ
動的法 遅すぎるから 近似する
導くよ TATAボックスが 転写へと
配列に 見つけていこう モチーフを
配列の お宝発見！ パイレーツ
配列を 揃えてみれば 進化見ゆ
配列を 比べてわかる 枝分かれ
配列を 比較し学ぶ 未知の世界
配列解析 僕らのヒーロー 隠れマルコフモデル
分子時計 君と僕との 思い出は
分子時計 見つけた人に 感激だ
分子時計 私はどこで 生まれたの
文字ばかり 目まぐるしくて 嫌になる
保存性 配列変えず 次世代へ
未知のこと 隠れマルコフで 見つけよう
無駄のない 極めしフグの 設計図
目も耳も もともとおんなじ 設計図
予測したい 隠れないでよ マルコフさん
予測する ママの逆鱗 触れたくない
２週目
BLASTが 使える私は プロのよう
BLASTで あの子の配列 探したい
BLASTで タンパク質の 謎を解く
BLASTで 英語を解読 名探偵
blastで 塩基配列 速サーチ
BLASTで 起こせblast 解析に
Blastで 君の遺伝子 みーつけた
BLASTで 検索しよう 高速で
BLASTで 私の脳みそ BURSTだ
BLASTで 新たな未来を CRAFTだ
BLASTで 仲間探しの 旅をする
BLASTで 調べで広がる 知識かな
BLASTで 読み解いていく 種の垣根
BLASTで 未知の配列 理解しよう
blastで、探して探ろう 生命の根源
Blastに 塩基をコピペ くそだるい
blastの nかpか どっちやねん
BLASTの 破壊(blast)ボタン 爽快感
BLASTは FASTAより 超早い
BLASTは 似たもの探す 旅の網
BLASTは 配列を解く 切り札だ
blastへ 30億を 知りたくて
BLASTを 使いこなして 研究だ
BLAST君 頑張ってね BLAST君
BLOSUM スコアを咲かせ フィルタリング
FASTA 検索結果は 流れ星
FASTA 読み方ちょっと 難しい
GCA 配列調べ 真実へ
my汚部屋 フィルタリングが 使えたらなあ
OC の 分類長すぎ 眠くなる
PUM積み 時を超えても まだ似てる
アミノ酸 タンパク質の 進化前
アミノ酸 私を作った このキセキ
アミノ酸 配列比較 学ばなきゃ
アミノ酸 比較は進化の 謎解きだ
アラインメント スコアを与えて 最大化
アラインメント 最大の道で 迷子になる
あらわれる 神秘の模様 ドットマトリックス解析
ギャップ見て 進化の旅を 思い知る
スコア出す 最適解への 道しるべ
だるすぎる アラインメントの 計算法
タンパク質 変異すべしと 言ひけるか
データベース 略語だらけで 解読班
データ海 揺れる真理を 釣り上げる
テスト前 脳内シナプス 迷子中
バイオはね 奥が深いよ 楽しいよ
パソコンで BLAST検索 ヒートショック
ハッシュ表 短く分けて 早く探す
パブメドと ブラストさんも 愛したい
パワポ見て 分からない問い 悲しいね
ヒト、バナナ 遺伝子半分 一緒なの！！
フィルタリング ノイズを除き 第1歩
ブラストが 素早く導出 情報を
ブラストで DNAを 理解したい
ブラストで ドカンと結果 出てきたよ
ブラストで 塩基の海に 溺れそう
ブラストで 描く生命の 樹形図だ
ブラストも 優先事項は 効率だ
プロテイン 比べてわかる うれしいな
ペアワイズ hiジョージそれ ペニーワイズ
ペアワイズ イットのピエロが 浮かんじゃう
ペアワイズ ズレにときめく ギャップ萌え
ヘモグロビン 人とマウスは 家族だよ
もとめよう アルゴリズムで いっちどを
ルーレット 今日はなかった 一安心
遺伝子を 読み解く先に 未来あり
英文字の 羅列にミクロの 世界を見る
塩基たち たてよこななめで スコア競う
塩基まで 性格診断 FAST-N
塩基読む 目が迷い込み またはじめ
塩基列 読み解くたびに 親戚増える
解析で 見れない歴史 見つけ出す
解析で 見破っちゃうぞ 君の祖先
解析を すれば見えるよ 情報が
環境の 適応進化で 生き延びる
客観性 それは誰かの 主観あり
久しぶり 期待値0の 親戚だ
局所的 アラインメント 難しい
局所的 大域的とか まじわからん
筋トレを 支えてくれる イソロイシン
計画立て 枝分かれして 迷い道
再履修 周りと学年 ギャップあり
似た配列 BLASTにかけて 友を知る
新しい 配列データ 登録を
進化知る ATGC 配列だ
西野さん 配列話し ご満悦
昔から ずーっと一緒 おー揃ぐ遺伝子
相性を 一目で分かろう ペアワイズ
相同な 遺伝子重複 パラロガス
相同を 探して見つける 分岐点
相同性 配列比べて 進化知る
大域的 人生でここしか 使わない
短き鎖 つなぎ合わせて ゲノム地図
地道だね 格子グラフで 1歩ずつ
置換から 祖先の影が 見えてくる
長い配列 二人溜息 見つめあう
点をかく アラインメント むずかしい
動的に 計画しよう 人生も
配列で 検索するなら BLASTへ
配列で 見える僕らの 共通点
配列の ギャップ領域 ギャップ萌え
配列の データベースの 拡大を
配列の 海を渡りて 先祖知る
配列を スコアで比較 計算機
配列を 解いてもわからぬ 種の起源
配列を 調べて比べて 始祖を知る
配列を 比べて気づく 祖先の縁
不一致ゼロ ギャップを活用 局所勝ち
別れ際 アルビフローラ また明日
変わらない 老舗の味だ ヘモグロビン
変わるもの 変わらぬものに 意味を知る
目を凝らし 配列と表 読み取ろう
欲しい情報(もの) はっきりデータサイエンス
旅に出て 似てる配列 突然に
１週目
Gene太郎 「TTAT」 流行るかな
Meshして 復習テスト 乗り越える
PCと The cellの重み ふと感謝
Pub Med 項目おおいよ もう面倒
PubMed 気になるあの子も 見つかるか？
pubmed 検索項目 ほぼ呪文
PubMed 研究者たちの 灯台よ
PubMedさん これからよろしく 頼みます
PubMedで 自分の名前 出てみたい
PubMedで 卒業方法 調べたい
Pubmedを 使う機会が まだ来ない
いつか出す 俺の論文 調べてね
ウイルスが 唯一持てる 一本鎖
カチカチと 漁る論文 進む秒針
キーワード 選んで論文 絞り込もう
ゲノムとは 歴史を語る 螺旋模様
ゲノムより あの子の心 よみたいな
ゲノムより 複雑すぎる 課題群
ゲノムをね 解析してくよ どこまでも
ゲノム読む 塩基の海に 溺れてく
このサイトに 世界の知識 つまってる
サイエンス スペルどっちだ SかＣ
データ駆使 生命科学が まるわかり
データ多い でもわからない ちょっと眠い
データ量 再履の僕も オーバーフロー
どうしよう 生物なにも わからない
バイオイン フォマティックスは 帰れない
バイオをデ ータで導き 科学する
パソコンで 論文探し 新鮮だ
パソコンも 頭も検索 フル回転
パブメッド そして俺は ギフテッド
パブメッド 今学んでも いらなそう
パブメドが わかんなすぎて 意気消沈
パブメドで ゲノムを発見 楽しいな
パブメドで すぐに探せる 便利だな
パブメドで 集めろダルめの 学説を
パブメドで 生命論文 読み放題
パブメドで 論文たちを 熟読だ
パブメドよ 友達なろう 末ながく
パブメドを 開いてすぐに 睡魔くる
パブメドを 用いてみよう 論文に
びっくりだ 西野先生 イケオジだ
ヒトゲノム ３GBの 情報量
プラナリア 無限の命 俺も欲し
ランダムの ルーレット知り よい態度
リボソーム 名前が似てる リソソーム
ルーレット 生物未履修 ドキドキだ
遺伝子の 配列決定 祖先知る
遺伝子を 読むはパソコン 解くは人
遺伝子解析 コードが多すぎ 頭もいたし
一文字が 未来を変える 塩基かな
運動後 sleep resist [mh] PubMed
英語から 生命の謎 解き明かす
英語力 なくては読めない データの山
課題重！ うわさ通りだ がんばるぞ
解析で 未知の生命 解明す
簡単に 高度な検索 pudmed
久しぶり 西野先生 受験ぶり
君と僕 遺伝子何個 違うかな？
検索の 腕を磨いて いいアイデア
吾輩は 塩基の並び 解析中
項目を 使って論文 絞り込み
査読越え 知識はやがて 教科書に
査読付き 辛口コメント やり直し
再現性 信頼できる 査読付き
細胞さん ヘンな遺伝も 残しがち
授業受け 遺伝子改変 したくなる
初回から 課題むず過ぎ 困ったよ
小テスト 難しすぎて トホホホー
情報を 集めて嬉し ゲノム川
情報を 進化のごとく つないでく
情報基礎 単位は取ったが 活かせない
新発見 先に書かれた 総説が
真核と 原核生物 区別する
神秘こそ DNAの 魅力だな
身体を 探検しよう Pub Med（パブメド） で
水曜日 頑張りたいと 意思表示
正確に 調べてみよう PubMedで
生シスが 生命情報 あばいたる
生物の 解析データで 革新を
生物の 最小単位 細胞だ
生物の 単位ゼロ個で クイズ無理
生物の 知識が抜けてて 悲しいな
生物の 論文探し みについた
生物も 英語も苦手で ５ねんせい
生命の 仕組み知りたい お年頃
生命路 インフォマティクスで 未来解く
染色体 寄り添い重ね 組み替わる
染色体 並び整え 分裂だ
総説に 古い知識と 新発見
卒論が 近づいてくる 恐ろしい
打つ文字が 多くてなかなか 見つからず
大切だ データベースの 利用法
誰だって ネコにもあるよ DNA
単細胞 侮るなかれ 核ありき
知を求め pubmedの森で 論文狩り
動画では 操作しやすい はずなのに
二人とも クイズ解けない ペアワーク
配列を 並べて並べて 意味を問う
複雑に 絡まる情報 クロマチン
別れの時 最後まで一緒 アポトーシス
万博の 再生医療 涙出た
夜露咲く 桃色吐息(ペチュニア)の花 ナス科だね
恋心 君との恋は ラギング鎖
論文が 英語すぎて まじ分からん
論文で 仮説を発表 良い案だ！
論文で 世界を変えろ 理科大生
論文と 総説の違い 意外と知らない
論文の 逆引き出来て 一人前
論文の 検索方を よく学ぶ
論文は Pubmed 使って 探し出す
論文は 英語使うの 当たり前
論文は、ちゃんと調べて、結果出る
論文を 英語で読むの とても嫌
論文を 見てから思う 英語やろ
論文を 調べる私は 大人っぽい？
論文を、検索できる、正確に