2019年度生命情報川柳第4週優秀川柳賞/2019 Bioinformatics Haiku 4th week prize
先週は立体構造の情報について学びました。 立体構造は配列と比べると１つ次元が大きくなっているため 配列のように並べるわけにはいきません。 比較するためにはどことどこが同じかを回転や並進操作して比較する必要があります。 我々が目で見てなんとなく似ているかなというものは...
2019年度生命情報川柳第3週優秀川柳賞/2019 Bioinformatics Haiku 3rd week prize
先週は配列解析の二回目で複数配列の比較を学びました。 複数配列の比較はペアワイズアライメントと比較して格段に組み合わせが多くなります。 ペアワイズと同じ方法では天文学的な時間がかかってしまいます。 そこで計算時間の短縮のために様々な方法が開発されています。...
2019年度生命情報川柳第2週優秀川柳賞/2019 Bioinformatics Haiku 2nd week prize
先週はバイオインフォマティクスの基本である配列解析を学びました。 配列が全く同じものをデータベースから検索してくるのは簡単ですが、 一部違っているものをどのように判定するのか。 簡単なようで難しい問題です。 タンパク質では20種類のアミノ酸の置換をPAMという単位で変換確率...
小川くん、誕生日おめでとう
今日は小川くんの誕生日祝いをしました。 月例進捗会の後、白濱くんがシュークリームやケーキ、プリンを準備してくれました。 さらにポロのハンカチセットがプレゼントされました。 来年4月より就職した際には是非活用してください。 小川くん、誕生日おめでとう！！ Happy...
2019年度生命情報川柳第1週優秀川柳賞/2019 Bioinformatics Haiku 1st week prize
先週より後期の生命情報学講義が始まりました。 初回はイントロダクションを行なったのちに生化学や分子生物学の復習を行いました。 生命情報データベース紹介では文献データベースPubmedを取り上げました。 最近はグーグルスカラーというグーグルが取り扱う文献データベースもあります...
バイオカップ2019/Biocup2019
生物工学科の恒例スポーツイベントバイオカップを開催しました。 今回は主催幹事のため、会場準備から運営、管理、懇親会の企画や後片付けまでを研究室メンバーで分担しました。 まずはソフトバレーボール大会です。 試合はトーナメント制で今年は12研究室+OBOGチーム+2/3年生チー...
深野さん、小栗くん、池田くん、誕生日おめでとう！！/Happy Birthday, Amane, Kentaro, Akihito!!
本日は8月、9月に誕生日を迎える３人の合同誕生日会を行いました。 男子３人でチョコロールクレープケーキを準備してくれました。 巻き上がったケーキを見るとボリューム感がたっぷりです。 こちらを皆でいただきました。 ケーキに加えてそれぞれプレゼントも準備してくれました。...
2019年度生化学川柳第15週優秀川柳賞/2019 Biochemistry Haiku 15th week prize
先週は前期最後の講義で核酸の代謝を学びました。 遺伝情報のDNAやRNAはもちろんのこと、 生体反応で頻繁に登場するATPやNAD, FADも核酸です。 これらの物質は栄養から摂取した際に分解してしまうので体内で再合成されます。...
2019年度生化学川柳第14週優秀川柳賞/2019 Biochemistry Haiku 14th week prize
先週はアミノ酸の代謝について学びました。 前半でアミノ酸の構造と機能について学んだ際は アミノ基とカルボキシ基を持ったタンパク質の素というイメージですが、 代謝を学ぶと異なった側面が見えてきます。 アミノ基が失われると糖代謝や脂質代謝と密接に関わり、...
ゼミ旅行2019/Lab trip 2019
昨日、一昨日と秩父までゼミ旅行に行ってきました。 例年は秋口に行くのですが、 秋は研究室の行事が色々立て込んでいるので早めに行くことにしました。 旅行日程は４年生が決めてくれ、初日、二日目とバランスよくアクティビティーを行いました。 まずはちちぶ銘仙館にて藍染体験です。...