実習二日目です。 初日に実験をしていない班は実験計画書を、実験を行なった班はその結果を踏まえた上で実験計画書を提出したのちに実験スタートです。 タンパク質の実験は反応時間や電気泳動の待ち時間が多いということで 今年は論文課題を貸すことにしました。...

今年も3年生の実習の季節がやってきました。 内容は基本的には変えていませんが、 初日は９種類のサンプルのプラスミド情報を配布し、自分たちで検索して同定方法を考えるようにしたこと。 それらのサンプルから各班が５種類を選ぶようにしたので、 今までより班ごとでの違いが出ています。...

今日は横山くんの誕生日祝いをしました。 準備は白濱くんが担当です。 金町ロールケーキを皆でいただき、 プレゼントは今治のタオルセットでした。 横山くん、誕生日おめでとう！！ Happy Birthday, Koji!!

先週はパスウェイ解析と遺伝学的解析を取り扱いました。 次世代シーケンスにより生物ゲノムが次々に報告され、 様々な生物からの遺伝子が明らかになっています。 その結果、どの生物種でどの遺伝子が保存され、 どの遺伝子がなくなっているかを比較することができます。...

渋谷は大騒ぎになっているようですが、 怪我のないようにハロウィーンをお楽しみください。 Happy Halloween!!

先週は10月最初の台風の影響で休講になった分の補講を含めて2コマ連続の講義でした。 幸い内容はゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームと 生物のセントラルドグマのバイオインフォマティクス三連続となりました。 それぞれ異なる手法でデータが取り扱われています。...

先週は生体分子の立体構造バイオインフォマティクス を学びました。 配列が一次元情報なのに対して構造は三次元情報です。 構造の情報処理には膨大な計算が必要です。 そのような計算がどのように行われているか。 どのように効率よく行えるかを学びました。...

先週は配列アラインメント第二弾でした。 二つ以上の塩基配列やタンパク質配列をどのように簡便に整列するかはとても大切です。 似ている度合いをスコア化し、隠れマルコフ法によって挿入と欠失が取り扱われています。 今週の優秀川柳は以下の５句です。 マルコフに 任せてしまおう IとD...

昨日今日と軽井沢までラボ旅行に行ってきました。 車４台に分乗し、それぞれ軽井沢まで向かいました。 我々はM２の３人と一緒に中軽井沢でそば打ち体験をしました。 講師の女性が、そば粉を練るところから茹でるところまでを丁寧に指導してくれました。...

先週は台風の影響で休講となり一週空いてしまいました。 バイオインフォマティクス の第一歩は配列解析です。 現在ではヒトの遺伝子も１０万円ほどで配列決定できる時代です。 そのようにして決定した配列が他の配列とどの程度似ているのか、違っているのか、...