先週は10月最初の台風の影響で休講になった分の補講を含めて2コマ連続の講義でした。 幸い内容はゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームと 生物のセントラルドグマのバイオインフォマティクス三連続となりました。 それぞれ異なる手法でデータが取り扱われています。...

先週は生体分子の立体構造バイオインフォマティクス を学びました。 配列が一次元情報なのに対して構造は三次元情報です。 構造の情報処理には膨大な計算が必要です。 そのような計算がどのように行われているか。 どのように効率よく行えるかを学びました。...

先週は配列アラインメント第二弾でした。 二つ以上の塩基配列やタンパク質配列をどのように簡便に整列するかはとても大切です。 似ている度合いをスコア化し、隠れマルコフ法によって挿入と欠失が取り扱われています。 今週の優秀川柳は以下の５句です。 マルコフに 任せてしまおう IとD...

昨日今日と軽井沢までラボ旅行に行ってきました。 車４台に分乗し、それぞれ軽井沢まで向かいました。 我々はM２の３人と一緒に中軽井沢でそば打ち体験をしました。 講師の女性が、そば粉を練るところから茹でるところまでを丁寧に指導してくれました。...

先週は台風の影響で休講となり一週空いてしまいました。 バイオインフォマティクス の第一歩は配列解析です。 現在ではヒトの遺伝子も１０万円ほどで配列決定できる時代です。 そのようにして決定した配列が他の配列とどの程度似ているのか、違っているのか、...

今年も生物工学科のスポーツイベントバイオカップが開催されました。 今年の競技は研究室対抗のソフトバレーボールです。 当研究室の結果は予選リーグ２敗、敗者リーグ初戦敗退という結果でした。 怪我なく終えたのが幸いです。 懇親会は昨年と異なり食堂で行われました。...

修士２年の紅一点、佐藤さんの誕生日お祝いをしました。 後輩女子チームによるメークアップや洋服準備で主役の雰囲気もバッチリ出ています。 ケーキは横山くんが色とりどりのワッフルを用意してくれました。 プレゼントは大好きな天空の城ラピュタの紙工作です。...

本日はshortPR/PRアフター会の後、ナイトゼミを行いました。 今回はD2の池田くんが植物の自家不和合性について紹介してくれました。 被子植物でよく観察される自家不和合性ですが、 自家受粉を防ぎ、遺伝的多様性を確保するために存在すると考えられています。...

先週より第3クォーターが始まりました。 今期は２年の生命情報科学(バイオインフォマティクス)の担当です。 前期の生化学で学んだ生体分子をどのように取り扱うかを学びます。 生物学は幅広く、そこで取り扱う情報も様々です。 講義内容の復習を目的に生化学と同様に川柳を宿題にしていま...

午前中に夏休み明け第一回目のゼミを行った後、 深野さん、菱沼くん、池田くんの合同誕生日会を行いました。 三人分ということで普段以上に豪華なケーキやお菓子、飲み物を準備してくれました。 プレゼントも思考を凝らしたものでした。...