先週は転写と翻訳を学びました。 遺伝情報が細胞内で機能するためには、転写によってmRNAや他のRNAが作られて、 翻訳によってタンパク質が合成されます。 トランスクリプトームやプロテオームは、 いつ、どの遺伝子がどの程度転写、翻訳されたかをゲノムスケールで調べる手法です。...

先週はゲノムインフォマティクスを学びました。 次世代シーケンサーで次々とゲノム情報が解析され、 これまでにないほどの情報が蓄積されています。 ヒトのゲノム情報の概要が明らかになって20年経ちますが、 それ以降も様々な研究者の努力により遺伝子や染色体の構造、...

先週は構造バイオインフォマティクスを学びました。 生体分子は立体的な形状をとることで機能します。 立体特異性のある酵素やタンパク質は、本来結合する相手と、 鏡の向こうにある分子（鏡像異性体と言います）を見分けることができます。...

先週はマルチプルアライメントについて学びました。 一対一のペアワイズアラインメントに比べると計算量が飛躍的に増えてしまうことや、 どの配列とどの配列がどの程度似ているのかなど、 取捨選択するパラメーターも増えることからより難しくなっています。...

先週は配列解析に1回目の講義をおこないました。 配列解析の基本は相同性比較です。 比較するものが０か１であれば簡単ですが、 塩基配列では4種類、アミノ酸配列では20種類あります。 また、配列情報は一次元につながっているため、どこから初めてどこまでを比較するのか、...

先週より後期の生命情報科学講義が始まりました。 前期と同様に第一週目は完全オンラインのため、 Zoomにて講義の概要説明を行いました。 その後はバイオインフォマティクスで大切な文献検索方法を学びました。 文献検索サイトとしてはPubmed(https://pubmed.nc...

先週は期末試験を行いました。 約６ヶ月に渡って行ってきた生化学１講義の総仕上げです。 一部Zoom経由の受験者もいましたが、 殆どの学生はターミナル室のパソコンを使ってオンライン試験に望みました。 普段はオンデマンドの講義なので、中間試験以来の生徒との対面です。...

夏季休暇のため、更新が遅くなりましたが、 前回講義の優秀川柳発表です。 前回は生体化学反応のエネルギー論について学びました。 生命活動を続けるためには常に外部から栄養を摂取し、多くの反応はエネルギー通貨であるATPを利用します。...

小栗くんの誕生日お祝いをしました。 上田さんよりハンドタオルセットのプレゼントです。 小栗くんは４月から某商社に務める予定です。 暑い地域への海外出張にも役立ちそうですね。 小栗くん、誕生日おめでとう！ Happy Birthday, Kentaro!

井戸くんの誕生日お祝いをしました。 小栗くんよりBlueBottleCoffeeのタンブラーです。 お洒落やデザインにこだわりのある二人なので、 シンプルなデザインのタンブラーはとてもいい感じです。 エコ商品なので長く大切に使ってください。 井戸くん、誕生日おめでとう！...