先週はゲノムの解析方法について学びました。 個々の配列とは違った解析方法がたくさんあります。 優秀川柳は以下の５句です。 隠れても マルコフモデル 見つけるよ! GeneHacker 2連コドンで 高精度 ランダムに 断片解析 ショットガン インフルの ゲノム切り取る...

先週はタンパク質の構造とその比較や分類について学びました。 優秀川柳は以下の５句です。 SCOPや CATHで構造 分類しよう A,B,Z(エービーズィー) 右右左 A凝縮 同郷の あの子とわたしは アナロジー タンパクの ゆらぎの解析 玉とばね 無駄遣い PDBに...

先週は立体構造の比較方法／タンパク質の二次構造や三次構造予測について学びました。 ２０種類のアミノ酸によって構成されるタンパク質の構造構築原理、理解できましたか？ 優秀川柳は以下の５句です。 SCOPや　CATHで構造　分類しよう...

先週は配列比較二回目でした。 複数の配列をどのようにしたら効率よく比較できるかを学びました。 先週の優秀川柳は以下の５句です。 ペアワイズ それより多いと マルチプル マルコフと　マルコフニコフは　別人だ マルチプル　SPスコアで　進化比較 言葉にも 重みが無いなら ...

研究室メンバーと一泊二日で鬼怒川にゼミ旅行に行って来ました。 初日は鬼怒川ライン下り、二日目には日光江戸村へと行きました。 今年は19人での参加でメンバーが増えて賑やかな旅でした。 思い出深いゼミ旅行になりました。

近年のゲノム解析で多くの遺伝子が明らかになり、 それらを比較するゲノム情報解析が盛んに行われています。 先週は塩基やタンパク質アミノ酸配列を比較するための原理を学びました。 先週の優秀川柳は以下の５句です。 ホモロジー FASTA(ファストエー)か...

今日は研究室の月例報告会shortPRです。 PRafter会の幹事は佐久間さん、渡邊くん、三武くんが務めてくれました。 PRafter会では皆で佐藤さんの誕生日を祝いました 横山くんがレアチーズケーキとプレゼントを用意してくれました。...

高野くんのコンストラクトが完成しました。 もともと大きな遺伝子だったのですが、 イントロンが複数存在したため完成までに時間がかかってしまいました。 構造生物学の解析はコンストラクト作成からがスタートです。 頑張ってください。

先週より後期の講義科目が開始しました。 前期は生化学でしたが、後期は生命情報科学(バイオインフォマティクス)です。 毎週の宿題は生化学同様川柳にしました。 今週の優秀作品は以下の５句です。 コムギです ヒトに完勝 ゲノム数 酸DE！ 塩基性なのは？ KR！ この授業...

夏休みを挟んだため少し遅くなりましたが、 深野さんと三武くん誕生日をお祝いしました。 菱沼くんがアップルパイを焼いてきてくれました。 パイ生地の下に敷いたグラニュー糖がカリカリとした食感でとても美味しかったです。 プレゼントはお父さん犬のマグカップで、蓋に耳がついていました...