2023年度バイオインフォマティクス川柳第二週目優秀川柳賞/2023Bioinformatics Haiku prize week2

先週は配列解析の一回目の講義です。

配列解析はバイオインフォマティクスの基本です。

DNAやRNAなどの遺伝情報やタンパク質のアミノ酸配列情報は生命の理解に欠かせません。

配列がどのような意味を持つのか、機能が何どのようなものであるかを知るためには既存の配列との比較が重要です。

配列が完全に一致している場合は問題ありませんが、

一部が違っている場合、どの部分を比較するか、その違いをどのように評価するのかによって結果が異なります。

DNAやRNAの場合、４つの塩基を比較しますが、タンパク質の場合、２０種類ものアミノ酸を考慮する必要があります。さらに、配列比較では、一方に挿入または欠失がある場合もあります。

こうした多様なシナリオを考慮すると、効率的な比較が不可欠です。

BLASTは配列の長さや類似度に関係なく、高速で比較を行います。

さて、先週の優秀川柳は以下の10句です。

-検索の S級ヒーロー BLAST

-BLASTで 得られる情報 “爆”大だ

-BLASTは 有意なパターンで 高速化

-DNA 進化の歴史 語ってる

-ゲノム知る 占いよりも 確実だ

-もう一度 一文字表記 覚えよう

-小テスト 知識不足を 思い知る

-少しずつ 深まる縁と 授業内容

-ペアワーク 試されるのは ペアワイズ

-複雑な コードで繋がる 我らの輪

今年のノーベル医学生理学賞は、mRNAワクチンの発見と開発に貢献したカタリンカリコ博士と、ドリューワイズマン博士に授与されました。mRNAワクチンは、私たちの体内でタンパク質を作るための指示書を提供するもので、外部から来たmRNAを使ったワクチンは以前は安定性の問題から使用が困難でした。しかし、両博士はこの課題を克服するために修飾されたmRNAを開発し、これが新型コロナウイルスワクチンの成功につながりました。これは従来のワクチンよりもコストが低く、変異にも対応しやすいため、多くの人々の命を救う重要な成果となりました。